内蒙古自治区妇幼保健院是自治区唯一一家集保健、医疗、教学、科研为一体的三级甲等妇幼保健专科医疗机构。实际开放床位370张，目前在职职工904人。2014年，医院全年门急诊46.82万人次，住院人数1.96万人次，年分娩量8522例，各类手术4591台次。医院共设有43个科室,其中儿内科重症监护室（PICU）为国家临床重点专科，产科、新生儿科为自治区级重点专科，妇科、乳腺外科、儿外科、妇保科、儿保科、遗传优生科为医院重点科室，儿童眼科、儿童耳鼻喉科、儿童口腔科为医院特色科室。

目前医院正在实施整体外迁新建自治区儿童医院、妇产医院、妇幼保健院三位一体项目，该项目被列为自治区成立70周年献礼项目和重点民生工程。新医院占地220.56亩，建筑面积14.86万平方米，设计床位800张，现已完成主体建设，预计2016年完成内外装修工程，2017年7月开诊。

新医院将围绕“三个医学中心”进行建设，即：围产医疗保健中心、妇女医疗保健中心和儿童医疗保健中心。通过具有鲜明特色的医疗与保健工作有机结合，为广大妇女儿童提供覆盖整个生命周期、全方位的医疗保健服务，新医院成为广大妇女、儿童就医的首选医院,新医院建成后将成为一所花园式医院、地标性建筑，成为自治区妇、儿专业龙头医院。