扬州市妇幼保健院始建于1951年，1996年与妇幼保健所合署，2009年成为扬州大学医学院附属医院，是一所集医疗、保健、教学、科研等于一体的“三级甲等妇幼保健机构”。床位设置450张，设一级科室45个，二级科室43个。现有在职职工803人，其中高级专业技术人员143人，博、硕士研究生40余人。年门诊诊疗56万余人次，年出院1.9万余人次，年分娩量近8000人次。
近年来，医院先后成为“中国妇产科医院联盟会员单位”、“上海市红房子妇产科医院技术指导单位”、“扬州市妇幼保健联合体龙头单位”、“扬州市新生儿急救中心”、“扬州市危重孕产妇救治中心”。2015年荣获“全国百家优秀爱婴医院”称号。
2016年9月，扬州市人民政府常务会议决定：将结合市儿童医院新建和市妇幼保健院迁建，按照三级专科医院标准，在广陵新城158亩地块上，新建“扬州市妇女儿童医院”，床位设置1000张，于2020年整体搬迁。
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