惠东吉隆协和医院设有神经内科、心血管内科、肾内科（含内分泌科）、消化内科、呼吸内科、神经外科、骨科、普外科（含肝胆外科、小儿外科、胸外科）、泌尿外科、眼科、耳鼻喉科、妇产科、儿科、新生儿科、急诊科、ICU、皮肤科、中医科、口腔科、美容科等20多个临床科室。上述科室全天候接诊门急诊患者，节假日不休（具体坐诊时间以挂号处公示为准）。以外科微创中心（含腔镜）、创伤骨科、脑病中心、妇产科、健康体检中心为特色学科。医院汇聚了来自全国各地临床经验丰富﹑专业技术突出的专家作为各科室学科带头人。开展了神经介入治疗术、腹腔镜下胆总管切开取石术、肠癌根治术、逆行胰胆管造影术（ERCP）、经皮肾镜取石术、输尿管镜取石术、前列腺电切术、经腹腔镜妇科手术、各种无痛诊治技术（无痛分娩、无痛人流、无痛内窥镜术）等特色技术。同时开展了危急重症抢救，医院在心肌梗塞、脑血管疾病、癫痫、糖尿病、慢性阻塞性肺病、肾病的救治方面和脑外科疾病、手外科疾病、高危妊娠、各类创伤的救治方面达到先进水平。 医院拥有德国西门子1.5T超导核磁共振(MRI)、16排螺旋CT﹑飞利浦数字减影血管造影机（DSA）、大型高压氧舱、美国雅培全自动生化系统、高档彩超。配备有美国真彩数码电子镜﹑宫腔镜﹑腹腔镜﹑经皮肾镜、输尿管镜等离子电切镜，红外线乳腺诊断治疗仪；有日本进口的准分子激光治疗仪；还有配套设施完善的重症监护中心ICU和新生儿重症监护中心（NICU）。 医院本着“以人为本，诚信办院”的宗旨。采用数字化信息系统，集医疗管理、影像、检验以及临床系统于一体，简化患者就医流程，实现快速、精准的诊断，准确用药，准确治疗。推行人性化医疗和保健服务。以病人放心﹑舒心﹑安心为服务宗旨，相继推出网上专家在线咨询、网上预约就诊、电话预约、客户服务中心现场解疑排忧、便民直通接送车等多项便民服务措施。