北京按摩医院始建于1958年，中央直属事业单位，隶属中国残疾人联合会，是北京市中医管理局注册的二级甲等中医专科医院和北京市基本医疗保险定点专科医院，现有职工400余人。临床科室有：推拿科、儿科、针灸科、内科、皮科、特需门诊、治未病科、康复科、医学影像科、门诊办公室等及相关医技科室。
2022年下半年，北京按摩医院二期将在朝阳劲松地区落成并面向社会开放，届时建筑面积4万平方米、床位300张，并逐步增设骨伤科、麻醉科、耳鼻喉科、妇科、外科、急诊科、感染性疾病科等科室。
北京按摩医院作为推拿专科医院，先后承担国家中医药管理局“十一五”、“十二五”、“十三五”推拿重点专科（专病）建设。在完成临床医疗任务的同时，还大力开展推拿人才培训及科研学术活动。目前，承担北京中医药大学、滨州医学院、长春大学特教学院、北京联合大学特教学院等院校的临床实习带教工作，建成王友仁、师瑞华、王丽平、王麟鹏、支满霞、符仲华等薪火传承老中医工作室，先后培养了百余名中医推拿专科继承人。医院积极开展国际交流合作，与瑞士、爱尔兰、日本、克罗地亚等多个国家进行学术交流和技术合作。