医院始建于1950年3月的怀化县人民政府卫生院，1956年更名为怀化县人民医院；1983年更名为怀化市人民医院；1994年通过评审成为二甲医院；1998年升格为怀化市第三人民医院、怀化卫校附属医院；2000年确定为怀化医专附属医院；2005年经省卫生厅同意设置为三级医院；2015年10月经省人民政府批准，更名为湖南医药学院第一附属医院；2017年11月晋升三级甲等医院。

医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的国家三级甲等综合医院，总占地面积214.59亩，总建筑面积9.69万㎡，编制病床1200张，设临床医技科室46个，临床教研室18个，在职职工1294人，卫生专业技术人员1124人，其中高级职称223人，硕博士学历119人，国务院特殊津贴获得者1人，湖南省优秀中青年专家1人。湖南省121人才2人，湖南省225人才2人。拥有心血管内科、呼吸内科、护理学3个省级临床重点学科。是国家住院医师规范化培训基地、国家Ⅰ期药物临床试验中心、中国创伤救治联盟高级创伤中心、国家肺癌防治联盟肺结节诊治分中心、中西医结合博士后科研流动站、博士后创新创业实践基地、湖南省慢阻肺同质化培训基地、湖南省个体化给药咨询怀化分中心、湖南省呼吸与危重病临床医疗示范基地、湖南省多发重症创伤救治临床医疗示范基地、湖南省心肌损伤治疗临床医疗示范基地、湖南省创伤中心、湖南省胸痛中心、湖南省卒中联盟、怀化市护理学会理事长单位、急性肺损伤预防与干预市级重点实验室。

拥有23个市级重点专科，7个省级省临床重点专科建设项目，10个市州级省临床重点专科建设项目，是12个市级专业质量控制中心挂靠单位，14个市级专业委员会主任委员及学组挂靠单位。